Beobachtung der Zusammensetzung von Mikrobenpopulationen und ihren natürlichen und induzierten Veränderungen durch Trennung und Darstellung ribosomaler Nukleinsäuresequenzen

In der vorliegenden Arbeit wurde die bakterielle Diversität in den Habitaten Boden, Rhizosphäre und Rizoplane von Luzerne in Gewächshäusern durch Auftrennung amplifizierter eubakterieller 16S rDNA und rRNA-Fragmente anhand der Temperatur Gradienten-Gelelektrophorese (TGGE) untersucht. Ziel war die Analyse des Ausmaßes der Beeinflussung durch eine Inokulation mit dem durch eine luc-Markierung gentechnisch veränderten Sinorhizobium meliloti Stamm L33 - der sich wie der Wildtypstamm verhält - im Vergleich zu der natürlichen Variabilität der bakteriellen Gemeinschaft in Abhängigkeit der Faktoren Pflanzenart, Bodentyp und zeitliche Entwicklung der Pflanze. Hierzu wurden die TGGE-Muster der bakteriellen Gemeinschaften von Roggen, Bohne und Klee verglichen mit denen von Luzerne, die in drei verschiedenen Bodentypen angezogen und zu verschiedenen Wachstumsphasen geprobt wurden. Anhand von Clusteranalysen zeigte sich, daß in der Bodenfraktion der Bodentyp den größten Einfluß auf die bakterielle Gemeinschaft hatte, während in der Rhizosphäre und Rhizoplane der Pflanzenfaktor dominierte. Die durch eine Inokulation mit S. meliloti L33 bedingten Veränderungen lagen in der selben Größenordnung wie die zeitliche Variabilität der bakteriellen Gemeinschaft in Abhängigkeit des Pflanzenwachstums. Diese Veränderungen waren aber deutlich geringer als die durch den Bodentyp oder die Pflanzenart bedingten Effekte. Anhand der Verwendung eines spezifischen TGGE-Primers konnte jedoch in einem Bodentyp eine stärkere Beeinflussung durch eine Inokulation bei zu L33 verwandten Rhizoplanebakterien (Verwandtschaft zu S. meliloti und Rhizobium leguminosarum) aufgezeigt werden.